池田理化オンラインカタログ

ホーム/研究機器カタログ/製品カテゴリから探す/34 受託解析サービス - 01 ライフサイエンス系/WET&DRY受託解析

WET&DRY受託解析
RNA-seq解析 / シングルセルRNA-seq解析

アメリエフ

報告書イメージ：RNA-seq解析-1

報告書イメージ：RNA-seq解析-2

報告書イメージ：RNA-seq解析-3

報告書イメージ：シングルセルRNA-seq解析-1

報告書イメージ：シングルセルRNA-seq解析-2

シーケンスから論文作成には欠かせないデータ解析まで込み
丁寧な解析手法と解析結果のご説明で、結果の解釈を支援
アメリエフのWET&DRY受託解析サービスは、キックオフミーティングで解析プラン提案、中間報告での解析方針や条件のディスカッション、最終報告で解析結果や図表の丁寧な説明等、web会議による顧客接点を重視する点が最大の特徴です。
アフターフォローとして自動化・システム化提案等も提供します。

【受託解析メニュー】
  • RNA-seq解析
  • シングルセルRNA-seq解析

特長

  • 実験と解析をワンパッケージでご提供
  • 研究目的にあった解析手法を選択し解析プランを組み立て
  • 解析内容と解析結果を丁寧に説明し、仮説検証に貢献します
　　　　
サービス名 RNA-seq解析 シングルセルRNA-seq解析
価格 お問い合わせください
比較表に入れる
お問い合わせ

比較表を作る

お問い合わせ


■RNA-seq解析
シーケンス ・ライブラリ調製
・Illumina社 NovaSeq™ X Plus / MGI社 DNBSEQ™ によるシーケンシング（PolyA、150PE）
バイオインフォマティクス解析 ・解析レポート、報告会（手法解説、結果解釈のディスカッション）、アフターフォロー（メールでのQ&A）
・発現定量解析：マッピング、 発現定量、階層的クラスタリング （ヒートマップ描画）、 主成分分析
・二群間の発現量比較解析（サンプル数によって組み合わせ数を決定）：Volcano plot
・エンリッチメント解析：Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
サンプル サンプルタイプ：total RNA（RNA抽出からの対応も可）
・総量：200ng以上
・液量：10µL以上
・濃度：20ng/µL以上
・RIN値：4.0以上with flat base line
・純度：OD260/280= 1.8～2.2、OD260/230≥1.8（no degradation, no contamination）

※サンプルQCでRNA総量またはRIN値が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます（再提出1回まで無償対応）
※シーケンシングは日本（NovaSeq:真核生物のみ）またはシンガポール・中国にて実施します
※対応生物種：ヒト・マウス・ラット　その他の生物種はご相談ください
※原核生物の場合、WET:1.5万円/サンプルの追加料金
※RNA抽出からご依頼時のサンプル要件： 分離細胞1.0×105細胞以上、組織切片10～30mg（追加料金あり）
※DRY（データ解析）のみの場合、FASTQファイル（生データ）から受付いたします

■シングルセルRNA-seq解析
シーケンス ・10x Genomics社 Chromiumによるライブラリー調製
・Illumina社 NovaSeq™ X Plus による120Gbのシーケンシング
・Cell Rangerによる発現定量
バイオインフォマティクス解析 ・解析レポート、中間報告および最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
・解析レポート、報告会（2回実施、手法解説、結果解釈のディスカッション）、アフターフォロー（メールでのQ&A）
・クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、
　クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化（Feature plot, Violin plot）、
　サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
・特定のクラスタに着目した再次元削減、サブクラスタリング
・擬似系譜解析
サンプル サンプルタイプ：細胞
・サンプルの状態：凍結保存（セルバンカー等で凍結）
・細胞数：106細胞以上
・細胞サイズ：直径30μm以下（40μmでフィルタリング、分散状態）
・細胞生存率：融解後の生存率90%以上を推奨
・その他：EDTA0.1mM以下、マグネシウム3mM以下、界面活性剤は含まないこと

※ヒトおよびマウス、ラット以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。
※シングルセル遺伝子発現解析では、機器を持ち込んでの出張ライブラリ調製サービスも承っております。
　また、提携ラボにサンプルを持ち込んで頂いてのご利用も可能です。詳細はお問合せください。
※DRY（データ解析）のみの場合、発現マトリクス（cellranger 出力結果）から受付いたします。
　それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。

キャンペーンページ

※価格及び製品仕様は予告なく変更されることがあります。
※価格に消費税は含まれておりません。
※日本国内への販売に限らせていただきます。また、製品によっては、当社から直接販売ができない地域がございます。
※会社名及び製品名は各社の商標または登録商標です。
※製品の設置状況や付加機能を分かりやすく表現するため、製品に含まれない商品をあわせて掲載している場合があります。
※表示金額以外に運送費、荷造費、搬入・据付費、組立設置費などを別途加算させていただくことがございます。

これより先は、弊社の製品に関する情報を、医療従事者の方に提供する目的として作成されています。
一般のお客様への情報提供を目的としたものではありませんので、ご了承ください。

あなたは医療従事者ですか？

はい いいえ