池田理化オンラインカタログ

NGS受託
シングルセルシーケンス

日本ジェネティクス

シングルセルシーケンス

数百から数万個の細胞遺伝子発現プロファイルを
個々の細胞で解析することが可能
10x Genomics社のChromium Systemおよび、Illumina次世代シーケンシングプラットフォームを用いることで、シングルセルシーケンスのソリューションを提供いたします。

特長

  • シーケンシング:NovaSeq 6000/PE150
  • 納期:シングルセル調製後 8週間~ (解析なしの場合)
  • 納品データ:fastqファイル形式
  • 納品方法:データダウンロード(100Gb未満)
  • 本サービスは事前面談が必須となっております。お気軽にお問い合わせください。
    
サービス名 10X シングルセルトランスクリプトーム解析パッケージ 120Gb(NV-SCRNA)
サービス仕様 ・シーケンシング:NovaSeq 6000/PE150
・納品データ:fastqファイル形式
・納品方法:データダウンロード(100Gb未満)
ライブラリー調製方法 ・10xGenomics Chromium Systemを用いてシングルセル化
・Chromium Single Cell 3’ Kitによる逆転写およびライブラリー調製
サンプル要件 培養細胞株もしくは組織から調製された、シングルセル状態の細胞/懸濁液の状態でご用意ください。
・細胞数:700~1200cells/μL、Total細胞数 104cells以上
(※実際にシーケンスされる細胞数は ~8000cells程度)
・細胞生存率:>90%推奨(最低でも>80%)
・細胞直径:40μm以下
データ解析 ■Cell Ranger解析(パッケージに含まれる)
デマルチプレクス、サマリーメトリクス(シーケンスの品質、検出された細胞数、細胞あたりの平均リード数、細胞あたり検出された遺伝子の中央値など)、ゲノムへのアライメント、遺伝子発現の定量化、発現プロファイルが類似している細胞をグループ化するクラスタリング解析、クラスタ間の発現差解析可視化

■標準解析(オプション)
・デマルチプレクス、シーケンスデータの処理と品質管理、ゲノムとのアライメント、  
細胞のコールとUMIのカウント、品質管理サマリーメトリクス(Cell Ranger/STAR)
・高変性遺伝子(HVGs)の同定、細胞サブポピュレーション同定、主成分分析(PCA)、細胞のクラスター同定、
次元削減と可視化、マーカー遺伝子検出(クラスター間差分発現解析)(Seurat)
・各種エンリッチメント解析(GO、KEG、パスウェイ、リアクトーム)、転写因子の機能アノテーション、
蛋白質間相互作用ネットワーク解析(Cluster Profiler等)
納期 シングルセル調製後 8週間~ (解析なしの場合)
価格 ¥798,000
比較表に入れる
お問い合わせ

※価格及び製品仕様は予告なく変更されることがあります。
※価格に消費税は含まれておりません。
※日本国内への販売に限らせていただきます。また、製品によっては、当社から直接販売ができない地域がございます。
※会社名及び製品名は各社の商標または登録商標です。
※製品の設置状況や付加機能を分かりやすく表現するため、製品に含まれない商品をあわせて掲載している場合があります。
※表示金額以外に運送費、荷造費、搬入・据付費、組立設置費などを別途加算させていただくことがございます。

あなたは医療従事者ですか?