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エピジェネティクス3次元クロマチン構造解析サービス
Dovetail® Micro-C/HiChIP MNase受託解析サービス

トミーデジタルバイオロジー

Dovetail® Micro-C/HiChIP MNase受託解析サービス

発展型Hi-CでTAD, Loop等の構造を捕捉
3次元クロマチン構造の解析を可能に
サンプルを送付するだけで、MNaseによるクロマチン断片化で配列に依存せず、最高の解像度でゲノム全体のクロマチンコンタクトの検出が可能なMicro-C、それにさらにChIP-seqを組み合わせたHiChIP MNaseを用いたエピジェネティクス3次元クロマチン構造解析データを得ることが可能な受託解析サービスです。
Micro-Cでは目的の解像度に応じてTADまたはループコールから、HiChIP MNaseでは抗体をCTCF, H3K4me3, H3K27ac, IgGから選択可能です(2021年4月現在)。

特長

  • サンプルからのDNA抽出、ライブラリ作成、シークエンス、データ解析までを完全受託可能
  • ライブラリQCレポート、シークエンスデータ(fastq)、コンタクトマトリクス(mcool, hic)
  • 解析元サンプル受領後およそ3ヶ月でデータ納品
    
サービス名 Dovetail® Micro-C project, TADs Dovetail® Micro-C project, Loops Dovetail® HiChIP MNase Project
内容 Micro-Cライブラリ作成、
イルミナシークエンス(330 M PE)、
TADs解析(10kb resolution)
Micro-Cライブラリ作成、
イルミナシークエンス(990 M PE)、
Loops解析(1kb resolution)
HiChIP MNaseライブラリ作成、
イルミナシークエンス、
データ解析
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